Заказник «Агинская степь» считается ценной природной территорией по нескольким причинам:
- Разнообразие флоры. 1 В степи насчитывается не менее 655 степных видов растений, многие из них лекарственные. 1 Среди самых ценных — нителистник сибирский, который произрастает исключительно в даурско-монгольских степях. 1
- Обилие птиц. 13 Территория заказника располагается на Восточноазиатско-Австралийском пролётном пути птичьих миграций. 13 Местные озёра — излюбленные места отдыха пересекающих Забайкалье птиц. 1 Учёные зафиксировали здесь не менее 250 видов пернатых, среди которых немало краснокнижных. 1
- Сохранение редких видов. 2 В границах заказника находятся места гнездования и токовища дроф, или около 2–3% мировой популяции этого подвида. 2 Здесь останавливается на летовку и собирается перед миграциями около 100 чёрных журавлей (1% мировой популяции вида). 2
- Культурно-историческая ценность. 2 В состав заказника вошли четыре памятника природы Агинского Бурятского автономного округа, каждому из которых посвящены легенды и предания хоринских бурят. 2 Эти места связаны с именами Чингисхана и героя бурятского эпоса Бабажи-Батора. 2
- Лечебные ресурсы. 4 На территории заказника находится памятник природы озеро Горбунка, известное своими лечебными характеристиками. 4 Основу лечебных свойств озера определяют его грязи — иловые отложения на дне водоёма. 4
Таким образом, ценность заказника «Агинская степь» заключается в его уникальности с точки зрения флоры, фауны, истории и лечебных свойств.