Японское море самое солёное среди дальневосточных морей из-за мелководности проливов и влияния летних муссонов. 2 Они обеспечивают большой приток пресной воды, несмотря на скромный по площади водосборный бассейн всех побережий Японского моря. 2

Солёность воды в этом море составляет 33,7–34,3 ‰, что несколько ниже солёности вод Мирового океана. 2 В зимний сезон на большей части поверхности моря солёность вод превышает 34‰, что обусловлено поступлением высокосолёных вод из Восточно-Китайского моря. 1 Менее солёные воды сосредоточены в прибрежных районах азиатского материка и островов, где их солёность уменьшается до 33,5–33,8‰. 1