Всемирное семенохранилище находится на Шпицбергене по нескольким причинам:

• Географическая изолированность и геологическая стабильность острова делают объект практически неуязвимым. 3
• Расположение в зоне вечной мерзлоты позволяет поддерживать идеальную температуру внутри хранилищ даже в условиях отсутствия электроэнергии. 1
• Высота расположения (130 м над уровнем моря) гарантирует, что потенциальный всемирный потоп, который спровоцируют растаявшие льды Арктики и Антарктики, обойдёт хранилище стороной. 2
• Отсутствие сейсмической опасности — регион лежит вне зоны сейсмической опасности, поэтому землетрясения железобетонному бункеру не угрожают. 2
• Доступность — западный берег Шпицбергена расположен вне комфортных для проживания людей зон, но он не так удалён от густонаселённых центров цивилизации, и даже в случае транспортного коллапса добраться до него будет несложно. 2
• Политический статус острова — Шпицберген с 1920 года является демилитаризованной зоной, чью территорию запрещено использовать в военных целях даже Норвегией. 1
• Наличие неиспользуемых угольных шахт — их приспособление под нужды владельцев хранилищ обошлось гораздо дешевле, чем потребовало бы создание таких комплексов с нуля. 1