Природные преграды, способствующие географической изоляции, возникают из-за изменений в ландшафте. 2 Например, при появлении горных массивов и хребтов, разломов земной коры, водных барьеров, лесополос. 2

Также к причинам географической изоляции относят дрейф тектонических плит. 5 В результате него происходит периодическое объединение материков и соединение в одной экологической нише нескольких популяций различных видов, а затем разъединение популяций выживших видов при расхождении тектонических плит. 5

Ещё одна причина — изоляция расстоянием. 4 Сильно удалённые друг от друга участки одной популяции оказываются практически полностью изолированными друг от друга из-за многократного превышения радиусов репродуктивной активности. 4