Воды реки Каньо-Кристалес меняют свой цвет в течение года из-за жизнедеятельности речных водорослей. 2 Они в зависимости от сезона, освещённости и температуры воды меняют свою окраску. 2

Большую часть года река имеет серебристо-зелёный цвет, как и большинство рек. 2 Однако с июля по ноябрь, в сезон между дождями и засухой, уровень воды становится идеальным для цветения водного растения Macarenia clavigera. 1

Этот эндемичный вид начинает активно производить пигменты — хлорофилл и каротиноиды, — которые окрашивают воду в яркие оттенки. 1 Красный цвет, самый заметный, связан с каротиноидами, защищающими растение от избытка ультрафиолета. 1