Воды Чукотского моря отличаются пониженной солёностью в некоторых местах из-за влияния речного стока. 4 В прибрежных районах, подверженных влиянию речного стока, распространяется тёплая распреснённая вода как результат смешения морских и речных вод. 4

Минимальна солёность у устьев рек (3–5 ‰). 1 В то же время в южной части моря солёность зависит от адвекции беринговоморских вод через Берингов пролив и пресноводного стока из рек. 3

Зимой характерна повышенная солёность (около 31–33 ‰) подлёдного слоя воды. 1 В летний период солёность меньше, увеличивается с запада на восток от 28 до 32 ‰. 1