Вода в озере Чаны солёная, потому что в водоём ограничено поступление пресной воды. 3

Большинство озёр питаются за счёт ручьёв, рек и дождевых вод, но в Чаны пресная вода поступает в ограниченном количестве. 3 Из-за этого минералы и почвы, смываемые с берегов, постепенно накапливаются, пресная вода испаряется, а в озере остаётся богатый минералами соляной раствор. 3

Степень минерализации различается в разных частях озера: Малые Чаны практически пресные, Большие солоноватые, а Яркуль самый солёный. 5