Вода в дельте Кубани может быть солёнее, чем в остальных районах реки, по нескольким причинам:

• Сокращение притока речной воды. 1 В 20–30-х годах XX века из-за перекрытия истоков ряда ериков и обвалования основных рукавов дельты произошло заметное осолонение вод многих лиманов. 1
• Влияние морской воды. 1 В некоторые лиманы, например Курчанский, с одной стороны сбрасываются воды с рисовых полей, а с другой — поступает морская вода. 1 В результате в направлении к морю солевой состав лиманных вод изменяется. 1
• Влияние антропогенной деятельности. 1 На состоянии вод бассейна Кубани отражается, в частности, использование минеральных удобрений и пестицидов в сельскохозяйственном производстве. 5

При этом минерализация речных вод в бассейне Кубани изменяется от истоков к устью: отмечается увеличение минерализации вод в притоках реки в направлении с юга на север. 5