Ваттовое море называют природным заповедником из-за его уникальной экосистемы. 2 Все острова и островки, прибрежные пустоши, торфяники, заболоченные леса и приморские луга образуют единственную в Европе экосистему Ваттового моря, которая находится под охраной. 2

Ваттовое море имеет богатую флору и фауну и высокую биологическую продуктивность. 1 Особенно важную роль оно играет для сохранения популяций животных северо-запада Европы. 1 Например, здесь выводятся мальки почти всего поголовья камбалы Северного моря, а от состояния ваттов зависит благополучие центральноевропейской популяции обыкновенного тюленя. 1

В 2009 году 66% территории Ваттового моря было включено в список Всемирного наследия ЮНЕСКО в Нидерландах и в Германии как «одна из последних масштабных природных экосистем приливной зоны, в которых естественные процессы продолжают функционировать в значительной степени без вмешательства человека». 1