Васюганский заповедник имеет важное международное значение по нескольким причинам:

• Уникальная экосистема. 1 Это место обитания многих представителей флоры и фауны, в том числе редких, а также место их распространения по прилегающей территории. 1 В торфяниках Васюганских болот законсервирована информация о прошлом Земли за десять тысяч лет. 1
• Стратегический источник пресной воды. 24 Большое Васюганское болото является хранилищем значительных запасов относительно чистой пресной воды. 2
• Международное значение водно-болотных угодий. 2 Большое Васюганское болото включено в перспективный список Рамсарской конвенции о водно-болотных угодьях, имеющих международное значение. 2
• Роль в регулировании мирового климата. 3 Болота выполняют функцию глобального кондиционера, они охлаждают атмосферу, поглощают углекислый газ и связывают его, сокращая парниковый эффект. 1
• Привлечение исследователей. 1 Интерес к заповеднику проявляют учёные из Германии, Франции и других стран. 1

Васюганское болото в 2007 году было включено в предварительный список объектов Всемирного наследия ЮНЕСКО. 3