Васюганские болота важны для сохранения биоразнообразия по следующим причинам:

• Они служат природным резерватом для различных болотных ландшафтов и обитающей в них флоры и фауны. 2 Здесь сохранились большие популяции находящихся под угрозой исчезновения растений заболоченных лесов и болот, нашли приют и успешно размножаются промысловые виды таёжной фауны. 4
• Болота являются местом обитания редких видов живых организмов, птиц и животных. 3 Здесь обитают крупные кулики, сапсаны, беркуты, рябчики, куропатки, а также несколько вымирающих видов птиц, встречающихся только в этих местах. 3 Из животных на Васюганских болотах и прилегающих к ним территориях водятся соболь, лось, северный олень, изредка встречается медведь. 3
• Болота служат естественной перевалочной базой для многих тысяч перелётных птиц в период весенних и осенних миграций. 4

Кроме того, благодаря огромным запасам торфа за год Васюганские болота поглощают до десяти миллионов тонн углекислого газа и способствуют выделению более четырёх миллионов тонн кислорода. 3