Высочайшие горные вершины в Сахаре встречаются в центральной части пустыни, где близко к поверхности подходят кристаллические породы фундамента платформы. 5

В рельефе им соответствуют глыбовые нагорья Ахаггар (высота до 2906 м, гора Тахат) и Тибести (высота до 3415 м, гора Эми-Куси — высшая точка Сахары). 5 Эти районы несут следы активного вулканизма времён неогена и антропогена и расчленены глубокими долинами с сухими руслами древних рек. 4

На севере пустыни Атласские горы препятствуют проникновению влажного воздуха со стороны Средиземного моря, что способствует засушливости региона. 23