Колонии малого суслика существуют в пустынях России по нескольким причинам:

• Оптимальные места обитания. 1 Для сусликов подходят более влажные участки с относительно богатой растительностью: разнотравно-злаковые сухие долины, понижения рельефа (низины, западины и пр.). 1
• Природная выносливость. 5 Суслики способны выживать даже в условиях пустыни. 5
• Высокая интенсивность размножения. 3 В связи с этим малый суслик не относится к охраняемым видам. 3

Однако на численность популяции влияют и другие факторы, например засухи и антропогенное воздействие (распашка земель, отравление зверьков химикатами, прямое истребление). 13

За последние 30 лет отмечено снижение численности и исчезновение отдельных популяций малого суслика. 3 Это связано с изменениями климата и другими факторами. 3