Огромное разнообразие растений в пустыне Сонора, в отличие от других пустынь Северной Америки, объясняется несколькими факторами:

• Субтропический климат. 1 Пустыня Сонора представляет собой экотон континентального масштаба между тропиками и умеренным поясом западной части Северной Америки. 1
• Двухмодальное распределение осадков. 4 Зимние штормовые ливни поливают красочные однолетники, такие как люпины и маки, а летние муссоны позволяют цвести как однолетникам, так и деревьям, имеющим тропическое происхождение. 4
• Разнообразная геология и обширная топография. 1 В пустыне представлены почти все биомы планеты, начиная от холодных хвойных лесов и заканчивая жаркими пустынями. 1
• Наличие эндемичных видов. 3 Например, кактус сагуаро, или карнегия гигантская, растёт только в пустыне Сонора и больше нигде в мире не встречается. 3

В результате в пустыне Сонора было идентифицировано более 2000 видов растений. 1 Наиболее обширно представлены виды из семейства сложноцветных, бобовых, злаков, гречишных, молочайных, кактусовых и бурачниковых. 4