Несколько причин, по которым в Псковско-Чудском озере наблюдается массовое развитие сине-зелёных водорослей:

• Высокое поступление в озеро биогенных элементов. 1 Талые и ливневые воды выносят с полей в озеро фосфор, азот, калий, которые вызывают бурное развитие водной растительности. 2
• Мелководность озера. 2 Летом мелководные озёра прогреваются настолько, что начинают цвести, в том числе происходит массовое развитие сине-зелёных водорослей. 2
• Газовый режим. 5 Для многих видов синезелёных водорослей большое содержание кислорода является губительным, и они вырабатывают защитные приспособления при его избытке. 5
• Щелочная среда. 5 Синезелёные водоросли предпочитают щелочную среду и хорошо развиваются только в водоёмах с рН 7,5–9,5. 5