Несколько причин, по которым в некоторых районах Сибири наблюдается заиление озёр:

• Разрушение берегов под воздействием волн. 1 Для водохранилищ на начальном этапе их существования этот процесс обеспечивает более половины всего объёма наносов. 1
• Осадки, приносимые впадающими в водоём реками. 1 На расширенных участках рек (каналов) при их впадении в озёра скорость воды уменьшается, происходит выпадение наносов. 1
• Жизнедеятельность живых организмов. 1 Раковины моллюсков, остатки отмерших растений вносят небольшой, но заметный вклад в заиление водоёмов. 1
• Избыточный рост высшей водной растительности. 1 Он вызывает заболачивание мелководных участков и заиление водоёма остатками растительности. 1

Также на состояние озёр могут влиять климатические факторы, например, количество выпадающих осадков. 34