Подземные реки образуются в результате инфильтрации атмосферных осадков (дождя и талого снега) в верхнюю часть земной коры. 14 Вода просачивается вглубь по порам, трещинам, пустотам. 1

Проходя сквозь пористые грунты, вода достигает водоупорного пласта — слоя породы, который не пропускает воду. 4 Там вода начинает накапливаться, образуя водоносный горизонт. 4

Также подземные воды могут пополняться за счёт:

• Просачивания воды из озёр и рек. 4 Вода из поверхностных водоёмов может проникать в землю через их дно. 4
• Утечек из водопроводных систем. 4 Неисправности в трубах могут привести к попаданию воды в подземные горизонты. 4
• Избыточного орошения. 4 При поливе сельскохозяйственных полей избыток воды также может просачиваться в землю. 4
• Конденсации водяного пара. 4 В порах горных пород водяной пар может конденсироваться, образуя подземную воду. 4

Особую роль в формировании подземных водных систем играет тектоническая активность. 2 Землетрясения и движения земной коры создают трещины и разломы, которые становятся «дорожной картой» для будущих подземных рек. 2