Некоторые части Аппалачей почти лишены растительности из-за хозяйственной деятельности человека и загрязнения атмосферы. 15
Аппалачи входят в состав «Промышленного пояса» США, где есть множество «грязных» производств, которые негативно влияют на экологию. 12 В результате загрязнения атмосферы кислотными дождями природные экосистемы Аппалачей испытали значительный стресс. 5
Кроме того, в течение XIX и начала XX веков аппалачские леса подвергались разрушительным рубкам и расчистке земель. 5 В настоящее время леса Южных Аппалачей сильно разрежены, а во многих районах совершенно сведены. 1
На характер почвенно-растительного покрова Аппалачей также влияют климатические условия: на севере преобладают смешанные леса, в наиболее высоких частях гор переходящие в хвойные, на юге — широколиственные леса. 13