Разница в температуре воды между восточным и западным побережьями моря Баффина связана с циркуляцией воды. 3

На востоке, вдоль берега Гренландии, на север перемещается относительно тёплая и солёная атлантическая вода. 3 На западе, у побережья Баффиновой Земли, проходит холодное, менее солёное течение, несущее воду из Северного Ледовитого океана. 3

Таким образом, температура воды на поверхности моря Баффина повышается с запада на восток. 14 Летом температура воды на поверхности составляет от 5 °C на юго-востоке до 0 °C на северо-западе, зимой — ниже –1 °C. 2

Также на температуру воды влияет то, что летом море Баффина прогревается слабо, так как значительная часть тепловой энергии расходуется на таяние дрейфующих льдов. 1