Образование множества озёр в Ленсойс-Мараньенсисе связано с тропическим климатом Бразилии, где территория парка находится вблизи экватора. 2

С декабря по июнь здесь идут проливные дожди, приносящие около 1200–1500 мм осадков в год. 1 Песчаные дюны не впитывают воду, и в низинах между ними образуются временные лагуны, которые могут достигать глубины до 3 метров. 1

В сухой сезон (с июля по ноябрь) вода постепенно испаряется, а озёра исчезают. 1 Но глубокие озёра, которые не высыхают до следующего дождливого сезона, позволяют существовать водным растениям, рыбам, крабам и черепахам. 2