Накопление гумуса в донных отложениях аквапочв происходит благодаря наличию автохтонного органического вещества. 1 Оно является сырьём для образования гумусовых веществ. 1

Основным сырьём для процессов гумусообразования и последующего образования гумуса является отмершая морская фауна. 1 По мере продвижения органики на глубину происходит её постепенное преобразование, в результате чего до дна доходит уже устойчивое к минерализации органическое вещество. 2

Также органическое вещество в донных отложениях образуется под влиянием жизнедеятельности микроорганизмов. 3 На процесс разложения органического вещества оказывают влияние воздух, влага и химический состав пород. 3 При недостатке воздуха и избытке влаги в донных отложениях создаются условия для анаэробного микробиологического процесса разложения. 3

Формирование и накопление гумуса переводит рыхлые осадки из категории донных отложений в категорию почв, которые и называются аквапочвами. 1