Причины образования метановых пузырей в Балтийском море остаются невыясненными. 2

По одной из гипотез, дно впадины находится в бескислородной среде, что способствует накоплению больших объёмов метана. 1

Также рассматривается вариант, что эрозия смывает в моря и океаны землю с сельскохозяйственных угодий вместе с удобрениями. 1 Из-за них в воде буйно цветут водоросли, что приводит к более интенсивному гниению и выделению метана. 1 Возможно, его накопилось в море так много, что дополнительный метан вода уже не может в себя вобрать и растворить, поэтому он сохраняется в виде пузырьков и беспрепятственно направляется к поверхности. 1

Ещё одна гипотеза — снижение способности морских микроорганизмов к фильтрации и разложению метана. 2 Это может означать серьёзные изменения в биологической активности и химическом составе воды. 2