Убежища не строятся в местах, подверженных затоплению, из-за возможных проблем с гидроизоляцией и устойчивостью сооружения в таких условиях. 25

В сложных гидрогеологических условиях необходимо предусматривать надёжную гидроизоляцию, установку водосборников внутри сооружения или возвышать убежище над уровнем земли. 2 В этом случае выступающие стены и покрытия обваловываются грунтом. 2

Однако возведение убежищ в зонах длительного затопления предусматривается при расчётной глубине не более 10 м. 2 В таких условиях их рекомендуется размещать на возвышенных участках местности, а при оборудовании входов предусматривать устройство тамбуров-шлюзов. 2

Также в убежищах, размещённых в зонах возможного катастрофического затопления, должны быть предусмотрены устройства, обеспечивающие контроль наличия воды над сооружением, а при возможном длительном затоплении в качестве аварийного выхода — специальные спасательно-эвакуационные средства. 4