Тюльпан поникающий считается исчезающим видом из-за сокращения численности в местах произрастания. 3

Некоторые факторы, влияющие на уменьшение количества растений:

• Изменение фитоценотической среды. 3 Тюльпан поникающий не выносит сильного задернения и затенения. 3
• Перевыпас скота. 3 Животные вытаптывают растения. 1
• Сбор на букеты и пересадка в частные коллекции. 35 Если сорвать дикий тюльпан, он не сможет размножиться и погибнет. 2
• Климатические факторы. 3 Растение страдает в засушливые годы. 3

Тюльпан поникающий занесён в Красные книги некоторых регионов России, например Алтайского края, Республики Башкортостан, Омской, Самарской, Саратовской и Челябинской областей. 5