Несколько причин, по которым тис ягодный практически исчез из дикой природы:

• Хозяйственная ценность древесины. 2 Ещё в древности тис использовали для опор жилищ и других хозяйственных целей, а позднее вырубали целые рощи на изготовление копий, луков, стрел и пушечных ядер. 1
• Медленный рост. 1 Сеянцы ежегодно прибавляют в росте всего 1–3 см, и в возрасте сто лет дерево едва достигает одного-трёх метров в высоту. 1
• Ядовитость. 12 Все части тиса, за исключением мякоти шишкоягоды, ядовиты. 1 Домашние животные, поев тисовую поросль, тяжело болели и даже погибали, поэтому вблизи жилищ тис вырубали. 1
• Хозяйственное освоение в местах обитания. 3 Численность тиса сокращается в местах хозяйственной деятельности, например при рубках лесов, строительстве газо- и трубопроводов. 3