Строительство плотин может вызывать проблемы для биоразнообразия в речных экосистемах по нескольким причинам:

• Изменение водного режима. 15 Это нарушает природное равновесие реки. 1 Например, когда реки перегорожены плотинами, рыба не может пройти на нерест, поэтому её количество резко падает. 1
• Фрагментация среды обитания. 2 Дамбы разделяют основное течение реки на отдельные участки, что ставит под угрозу выживание водных организмов. 2
• Нарушение миграции. 3 Многие виды совершают обязательные миграции как вдоль русла, так и на поймы, а плотины нарушают эту связь. 3
• Заселение и распространение чужеродных видов. 3 Изменение стока способствует заселению и распространению чужеродных видов и вытеснению ими аборигенных гидробионтов. 3