Шельфовые зоны имеют большое значение для экосистемы Байкала, потому что в их пределах интенсивно протекают гидро- и геодинамические процессы, влияющие на морфологию берегов и развитие наземных берегоформирующих процессов. 1

Кроме того, заплесковая зона, к которой относится и шельф, богата пищевыми ресурсами. 2 Здесь скапливаются детрит и бытовые отходы, которые являются благодатной средой для развития особых сообществ и оказывают существенное влияние на гидрохимический и микробиологический режимы интерстициальных и прибрежных вод. 2

Также грунты прибрежной и заплесковой зоны служат своеобразным буфером, фильтром, защищающим чистоту озера от сточных вод прибрежных посёлков. 2