Северобайкальск считается важным логистическим центром на Байкале, потому что он является опорным центром западного БАМа и обеспечивает надёжную работу магистрали, нагрузка на которую в последнее время существенно выросла. 23

Через город проходит Восточно-Сибирская железная дорога, через него по расписанию ходят маршруты в Москву, Красноярск, Иркутск, Кисловодск и Тынду. 4 Летом суда на подводных крыльях «Восход» соединяют Северобайкальск с Иркутском через порт Байкал. 1 Воздушным транспортом город связан с Иркутском и Улан-Удэ через аэропорт Нижнеангарска, расположенный в 23 километрах к северу от него. 1

Кроме того, Северобайкальск — самый крупный город на Байкале, при этом он отрезан от озера железнодорожными путями. 23