Седлоклювые ябиру занесены в Красную книгу из-за снижения численности. 3
Одна из причин сокращения популяции — сокращение естественной среды обитания из-за активного возделывания земель рядом с реками и озёрами. 1
При этом по международному природоохранному статусу седлоклювый ябиру относится к группе LC, то есть состояние его популяции в природе не вызывает опасений. 2 Однако в Южной Африке вид рассматривается как находящийся под угрозой. 2