Самшит колхидский оказался на грани исчезновения из-за завезения и распространения самшитовой огнёвки — вредителя, который был привезён из Италии в рамках подготовки к Олимпиаде 2014 года. 12

Гусеницы огнёвки пожирали листья и побеги самшита, а также опутывали заросли сплошным пологом из паутины. 3 Природных врагов у вредителя на Кавказе не нашлось, так как насекомые содержали ядовитые алкалоиды. 1

Кроме того, на состояние деревьев повлияли:

• Вырубка самшита ради ценной древесины в конце XIX века. 1 На восстановление насаждений медленнорастущего вида требовалось не одно десятилетие, поэтому площади самшитовых лесов значительно уменьшились. 4
• Аномальное повышение температуры, которое ослабило растения и сделало их более уязвимыми перед грибковыми и другими заболеваниями. 4