Рыбинское водохранилище считается важным для Волго-Балтийского водного пути, потому что через него проходит трасса канала. 14 Из общей длины 367 км на водохранилище приходится 66 км (Нижняя Шексна). 4

Волго-Балтийский водный путь доступен для судов грузоподъёмностью около 5000 т, грузы перевозятся без перевалки. 14 Крупные суда идут прямо по озёрам (вместо движения по обходным каналам). 14

Кроме того, вода в Рыбинском водохранилище при установившемся стоке находится почти на одном уровне в течение всего года, что важно для поддержания гарантированных габаритов судового хода. 4

Таким образом, Рыбинское водохранилище обеспечивает важную часть транспортной системы, соединяющей бассейны Каспийского и Балтийского морей. 15