Рябчик шахматный считается редким и охраняемым видом в разных регионах Европы и Азии, потому что его естественные заросли с каждым годом существенно сокращаются. 5

Некоторые причины уменьшения численности растения: сбор на букеты, перевыпас скота и осушение болот. 9

Рябчик шахматный занесён в Красную книгу и нуждается в охране. 59 Для этого устанавливают запрет на сбор, определяют сроки сенокоса и запретительные меры по выпасу. 5 Также проводят регулярные поиски новых локаций произрастания цветка и охраняют найденные популяции. 5