Реку Онегу считают судоходной только на отдельных участках из-за её порожистости. 14 На отдельных порожистых участках уклон достигает 3,41 м/км, что затрудняет прохождение судов. 1

Верхний судоходный участок реки проходит по маршруту Каргополь — озеро Лача и имеет длину 6 км, а нижний — от села Порог до устья, протяжённость — 30 км. 14

Также на решение о судоходности отдельных участков влияют сложные ледовые условия: на порожистых участках и в местах выхода родников вода замерзает не сразу, и лёд там бывает непрочным. 2

Таким образом, судоходность Онеги ограничена определёнными плёсами, где нет таких препятствий для движения судов, как пороги.