Реки внутреннего стока являются проблемой для некоторых стран Центральной Азии по нескольким причинам:

• Изменение климата. 14 Повышение температуры приводит к сокращению стока рек, увеличению частоты и интенсивности экстремальных погодных явлений, таких как засухи и наводнения. 4 Следствием изменения климата стало сокращение количества и объёмов ледников Тянь-Шаня и Памира, которые являются главными источниками пополнения речных бассейнов Центральной Азии. 1
• Рост населения. 4 Увеличение спроса на воду для сельского хозяйства, промышленности и бытовых нужд. 4 К 2050 году на фоне прогнозируемого демографического роста в странах Центральной Азии ожидается дефицит воды до 25–30%. 1
• Урбанизация. 4 Города потребляют больше воды, чем сельские районы. 4
• Неэффективное использование водных ресурсов. 14 В сельском хозяйстве региона используются неэффективные методы полива, что приводит к значительным потерям воды. 4
• Изношенность инфраструктуры. 3 Советские гидротехнические сооружения ветшают, а модернизация зачастую не проводится. 3
• Слабое взаимодействие стран региона. 3 После распада СССР каждая республика осталась наедине со своими проблемами и потребностями, что приводит к спорам по поводу распределения водных ресурсов. 3