Реки бассейна Амударьи могут становиться более мутными с юга на север по разным причинам, среди них:

• Антропогенные факторы. 1 Рост водозабора из реки и сбросы неочищенных коллекторно-дренажных вод ухудшают качество воды. 1 Загрязнения поступают в реку с сельскохозяйственными стоками с территории Туркменистана и Узбекистана. 1
• Рельеф. 3 В водосборной части Амударьи расположен ряд крупных горных хребтов Памиро-Алая и Гиндикуша с высотами до 7500 м и мощными ледниками. 3 Основное питание река получает от таяния сезонных и высокогорных снегов и ледников. 3
• Изменение климата. 35 Существует научная гипотеза, согласно которой в зоне формирования речного стока рек Центральной Азии в силу изменения климатических факторов произошло изменение гидрологического режима рек, когда начало половодья сместилось с летнего периода на весенние месяцы. 3
• Эрозия. 2 Взвешенные наносы поступают в каналы и коллекторы за счёт размыва их русел осветлённой водой из реки, а также с орошаемых полей со сбросными водами. 2