Река Вилюй является важным источником пресной воды для региона, потому что она и её притоки служат основным источником водоснабжения населения прибрежных городов и посёлков. 1
Средний годовой расход воды в реке составляет 1450 м³/с, а во время весеннего таяния льдов и снега уровень воды поднимается примерно на 15 метров. 12