Река Нижняя Тунгуска считается главным притоком Енисея по объёму стока, потому что имеет высокий среднегодовой расход воды — 3680 м³/с. 15

Это связано с тем, что питание Нижней Тунгуски преимущественно снеговое, а небольшую часть дают летние дожди. 1 В течение года расход воды сильно варьируется: самый большой приходится на июнь, когда завершается весеннее половодье, а самый скудный — зимой. 1 Это связано с тем, что река протекает через вечную мерзлоту и совсем не получает питания от грунтовых вод. 1

Кроме того, на время весенне-летнего половодья приходится 73% годового стока реки. 5