Река Мерси считается одной из самых чистых в Великобритании благодаря усилиям по очистке, которые были предприняты в 1985 году. 12 Тогда была организована Кампания бассейна Мерси (The Mersey Basin Campaign) — 25-летнее движение по очистке всей речной системы. 1
В 2002 году удалось достичь достаточной чистоты, чтобы рыба завелась на протяжении всей реки. 3 В 2009 году было объявлено, что река «чище, чем когда-либо со времён промышленной революции» и «сейчас считается одной из самых чистых в Великобритании». 2
Также качество воды улучшилось благодаря инвестициям компаний водоснабжения, жёстким мерам против предприятий, загрязняющих реки, уменьшению объёмов стоков, спускаемых производствами в водные пути, и изменениям используемых агротехнических приёмов. 4