Река Исеть считается важной для местной экосистемы по нескольким причинам:

• Богатство рыбных ресурсов. 5 В её водах водится множество рыбы, в том числе ценных пород: толстолобика, щуки и леща. 1
• Влияние на местную флору и фауну. 2 В истоках реки сохранились нетронутые реликтовые кедровники и лиственные леса, гнездовья птиц и убежища зверей. 1
• Роль природного буфера. 3 Приречные болота, заводи, пойменные леса, кустарниковые заросли и луга вдоль реки служат природным барьером, который очищает от загрязнений воду. 3

Однако активная хозяйственная деятельность человека привела к ухудшению качества воды и сокращению численности рыбы в реке. 5