Производство биоэтанола может усугубить мировой водный кризис по нескольким причинам:

• Потребность в большом количестве воды. 12 Для выращивания топливных культур, из которых производят биоэтанол, требуется много воды. 2
• Загрязнение водных ресурсов. 2 Оно происходит из-за сельскохозяйственного дренажа, который содержит удобрения, пестициды и наносы. 2
• Вырубка лесов. 1 Для производства биоэтанола из сахарного тростника часто нелегально вырубают тропические леса, что также способствует сокращению водных ресурсов. 1

Кроме того, для производства биоэтанола в развивающихся странах может возникнуть продовольственный кризис, так как для выращивания топливных культур могут использоваться земельные угодья, которые раньше предназначались для других целей. 14