Уровень воды в Миссисипи в дельте реки регулируется из-за особенностей питания её притоков. 14
Правые притоки приносят преимущественно талые воды (результат таяния снегов в Скалистых горах), левые — питают Миссисипи в основном дождевыми водами. 1
Весной уровень воды в Миссисипи повышается из-за таяния снегов в бассейне её правых притоков. 4 Особенно высоким уровень воды бывает летом, когда одновременно увеличивается сток как правых, так и левых притоков. 4
Для защиты от наводнений русло Миссисипи на некоторых участках укреплено системой искусственных дамб. 1 Также для сдерживания смещения дельты к рукаву Атчафалайа в дельте реки используется система дренажей и перемычек. 2