Изменение цвета воды в лесных озёрах при цветении водорослей происходит из-за высокой концентрации пигмента в клетках водорослей. 15
Под действием солнечных лучей и ультрафиолета сине-зелёные водоросли вырабатывают зелёный пигмент — хлорофилл. 1 Чем больше света поступает в воду, тем активнее размножаются бактерии и тем быстрее водоём зеленеет. 1
В зависимости от содержания в организме водорослей тех или иных типов пластид (например, хлоропластов или хромопластов) цвет воды может меняться от мутноватого и слегка зеленоватого до изумрудно-зелёного или тёмно-коричневого и даже красноватого (при размножении эвглены красной или багряных водорослей). 4