Эвтрофикация водоёмов при повышенных концентрациях фосфатов происходит из-за того, что в верхнем слое воды происходит концентрация биогенных веществ. 4 Это провоцирует активное развитие микрофлоры (прежде всего, фитопланктона, а также водорослей-обрастателей) в этой зоне и увеличение массы питающегося фитопланктоном зоопланктона. 4

Механизм воздействия эвтрофикации на экосистемы водоёмов следующий: 2

1. Повышение содержания биогенных элементов в верхних горизонтах воды вызывает бурное развитие растений в этой зоне (в первую очередь фитопланктона, а также водорослей-обрастателей) и увеличение численности питающегося фитопланктоном зоопланктона. 2
2. В результате прозрачность воды резко снижается, глубина проникновения солнечных лучей уменьшается, и это ведёт к гибели донных растений от недостатка света. 2
3. После отмирания донных водных растений наступает очередь гибели прочих организмов, которым эти растения создают места обитания или для которых они являются вышерасположенным звеном пищевой цепи. 2

Основные источники поступления в природные водоёмы фосфора и азота — промышленное производство, сельскохозяйственные источники и коммунальные сточные воды. 3