Эвтрофикация водоёмов происходит из-за избыточного поступления в них биогенных элементов, в первую очередь соединений азота и фосфора. 4

Избыток азота в почве может приводить к эвтрофикации, так как основные источники загрязнения азотом — сельскохозяйственные стоки, содержащие удобрения и отходы животноводства, сточные воды и атмосферные отложения азота, образующегося при сжигании или отходах животноводства. 2

Поступление биогенных элементов в водоёмы происходит в результате смывания с полей удобрений, а также с промышленными и коммунальными стоками. 3 Кроме того, биогенные элементы поступают с атмосферными осадками и из почв (в результате их эрозии, распашки, сведения лесов). 3

Основным эвтрофирующим элементом для морских водоёмов служит азот, для пресноводных — фосфор (иногда азот). 3