Природа Кавказского заповедника считается уникальной и привлекательной для туризма по нескольким причинам:

• Разнообразие флоры и фауны. 12 В заповеднике встречается более 3600 видов растений, грибов и других живых существ. 23 Здесь можно увидеть виды, которые сохранились с ледниковых времён и даже с эпохи динозавров. 23 В Красную книгу России занесено около 282 видов растений из заповедника. 23
• Уникальные экосистемы. 3 Некоторые болота на территории заповедника, например Луганское, имеют возраст более 8 тыс. лет. 2 Эти древние экосистемы продолжают сохраняться благодаря уникальному климату. 2 Ещё одной интересной особенностью является субальпийское высокотравье, где травы могут достигать высоты 2–4 метров. 2
• Разнообразие ландшафтов. 3 В заповеднике преобладают холмы, горные массивы и обширные альпийские луга, а также имеются многочисленные ледники и карстовые пещеры с запутанными подземными лабиринтами. 3
• Наличие горных рек и водопадов. 5 Украшением заповедника являются горные реки и водопады, а также горные озёра, спрятанные в котловинах. 5 Их число достигает 240. 5
• Наличие природных памятников и заказников. 23 На территории заповедника есть заказники, например, переднеазиатский леопард, который исчез с территории Западного Кавказа более 80 лет назад, но благодаря усилиям учёных, в 2016 году несколько особей были возвращены в свою историческую среду обитания. 23