Пресноводные экосистемы чувствительны к изменениям среды обитания, потому что в их основе лежат пищевые цепи и сети, и нарушения в каком-либо звене влияют на функционирование экосистемы в целом. 1

Некоторые факторы, которые делают пресноводные экосистемы уязвимыми:

• Минерализация воды. 4 Организмы обычно обитают в относительно узких пределах солёности. 4 Исключение составляют немногие группы, в первую очередь проходные рыбы, способные адаптироваться к изменению минерализации воды в широких пределах. 4
• Содержание кислорода. 4 В стоячих водоёмах этот показатель может снижаться из-за прекращения газообмена с атмосферой (например, зимой, в результате образования корки льда) или массового размножения бактерий при органическом загрязнении водоёмов. 4
• Появление чужеродных видов. 25 Они могут вытеснять местные виды и изменять условия воды. 5
• Глобальные изменения климата. 2 Например, повышение температуры воды может привести к массовому развитию сине-зелёных водорослей, что вызывает «цветение» воды и дефицит растворённого кислорода, вызывая массовую гибель рыб. 2

Особенно высокую чувствительность к переменам в среде обитания проявляют редкие и уязвимые виды, например, холодолюбивые водные животные (форель, кумжа) и ряд водных беспозвоночных. 2