Полыньи имеют важное значение для морских экосистем по нескольким причинам:

• Создание благоприятных условий для обитания многих видов морских организмов. 5 К полыньям приурочены, например, самые крупные птичьи базары высокоширотной Арктики, зимовки моржей, белух и гренландских китов. 2
• Влияние на время и силу цветения фитопланктона. 3 Эти микроскопические растения являются основой морской пищевой сети. 3 Именно на чистой воде в полыньях может начаться первое в году цветение фитопланктона. 1
• Воздействие на океанские течения. 1 У побережий полыньи порождают плотные массы воды, опускающиеся на дно океана и расталкивающие более лёгкие слои. 1 Это помогает создавать течения, доставляющие холодную или тёплую воду туда, где она при иных обстоятельствах не окажется. 1
• Переработка углекислого газа. 1 Фитопланктон, процветающий в полыньях, перерабатывает углекислый газ, забирая этот парниковый агент из атмосферы. 1 Отмирая, растительные организмы опускаются на дно, запирая углерод и не давая ему вновь оказаться в воздушной среде. 1