Несколько причин, по которым поезда с разным временем отправления могут отправляться с разницей в несколько часов:

• Пропускная способность инфраструктуры. 1 Расписание составляется с учётом неё, и время отправления может меняться в зависимости от типа поездов. 1
• Технологические окна. 1 Например, во время ремонта железнодорожного полотна расписание может сбиваться. 1
• Пробки. 2 Если поезд подходит к станции, ему могут придержать, чтобы он подошёл к нужному моменту, например, когда нужно втиснуться между электричками. 2
• Разная крутизна подъёмов. 2 Если подъём пологий, то скорость вверх и вниз почти не отличается, а если крутой — разница во времени будет немаленькой. 2

Также стоит учитывать, что все поезда в России отправляются и прибывают по московскому времени, что позволяет использовать единую временную систему и упростить процесс синхронизации движения составов. 4