Пантанал считается важным природным резерватом Южной Америки по нескольким причинам:

• Разнообразие флоры и фауны. 45 В Пантанале можно наблюдать редчайшие виды животных, птиц, рептилий и растений. 4 Здесь обитают, например, анаконды, кайманы, обезьяны, туканы, гигантские выдры, ягуары, тысячи видов бабочек и сотни видов птиц. 5 Среди растений — десятиметровые пальмы, дикие розы, огромные кувшинки, лилии и папоротники. 5
• Благоприятные условия для размножения исчезающих видов. 5 Чередование тропической влажности и засухи создаёт благоприятные условия для жизни многих животных и растений, которые в других местах находятся на грани исчезновения. 5
• Важность для экосистемы. 1 Болотистая местность Пантанала благотворно сказывается на природе и экономике Южной Америки: территория становится более плодородной, регулируется влажность почвы, в воздухе много кислорода, а ещё Пантанал питает озёра и реки. 1
• Развитие экотуризма. 3 В регионе развиты фотографические сафари и наблюдение за птицами, что способствует устойчивому развитию за счёт создания рабочих мест и улучшения местной экономики. 3

С 2000 года заповедная зона Пантанал находится под охраной ЮНЕСКО как объект всемирного наследия. 3