Несколько причин, по которым популяция пальи в Ладожском озере сократилась:

• Загрязнение водоёма. 14 В результате антропогенной деятельности качество воды ухудшилось из-за загрязнения нефтепродуктами, фенолами, солями тяжёлых металлов и хлорорганическими пестицидами. 4
• Утрата нерестилищ. 1 Это происходит из-за хозяйственной деятельности, в результате которой некоторые места для нереста были утрачены. 1
• Промысел и браконьерский лов. 1 На численность пальи в Ладожском озере влияет её промысел, значительный ущерб наносит браконьерский лов. 1
• Прекращение искусственного воспроизводства. 5 К началу 2000-х годов благодаря искусственному воспроизводству промысловый запас пальи достиг 280 тонн. 5 Но как только искусственно выращенную молодь перестали выпускать, численность пальи снизилась в четыре раза. 5

Учитывая ценность вида, в настоящее время палию снова начали воспроизводить на рыбоводных заводах Ленинградской области. 5